酶標儀功能加大的內部軟件，有包括中文在內的多種語言可供選擇。軟件功能包括：設置微孔板布局（包括空白、標準品、待測樣品、質控品等），顯示檢測結果，進行數據處理（包括動力學分析、數據預處理、曲線擬合、數據分類、質控等）。此外，FC還可以與電腦相連，通過使用功能更強大的Skanlt軟件對儀器進行控製和數據結果的分析處理。
吸收光檢測：工作原理與主要結構和光電比色計基本相同，在特定波長下檢測被測物的吸光值，稱為光吸收檢測（Absorbance，Abs）。隻做吸收光檢測的酶標分析儀實際上就是一台變相光電比色計或分光光度計，其基本工作原理與主要結構和光電比色計基本相同。光源發出的光波經過濾光片或單色器變成一束單色光，進入塑料微孔板中的待測標本。
該單色光一部分被標本吸收，另一部分則透過標本照射到光電檢測器上，光電檢測器將這一待測標本不同而強弱不同的光信號轉換成相應的電信號，電信號經前置放大，對數放大，模數轉換等信號處理後送入微處理器進行數據處理和計算，最後由顯示器和打印機顯示結果。特定波長下，同一種被檢測物的濃度與被吸收的能量成定量關係，即符合朗伯比爾定律。
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